1.选择证件齐全含菌量高的产品。 2.微生物肥料本身养分含量低，必须与其他肥料搭配施用。在施用微生物肥料时，由于微生物肥料中的微生物具有固氮、解磷、解钾、抑菌、活化土壤、提高养分利用率的作用，因此施用这类肥料后，可以适当减少化肥的施用量。 3.微生物肥料中的微生物需要在含水适宜的土壤中才能生长和繁殖，因此土壤湿度不能过干过湿。 4.微生物肥料不能和杀菌剂同时使用。 5.微生物肥料不论是做基肥，还是追肥，都不能暴露在土壤表面。 6.注意生产日期，放置时间过长的微生物肥料中的微生物的活性下降。 7.冬春季地温低，低温微生物的生长繁殖变慢、活性下降。应提高地温，用秸秆覆盖，有利于提高地温，增强微生物活性的作用 生物菌肥将打破中国施用30多年化肥的种植怪圈。土壤酸化、土地肥力下降等困扰中国土地种植现状的窘况，有望因生物菌肥的使用而破题。 泥炭略显酸性或强酸性，PH值为5.0－6.5；ＥＣ值小于１；持水量很高，一般有52％（V）；通气性良好，通气空隙在27-29%。由于质轻、持水、透气和富含有机。

目前常见的水稻育苗基质依据原料来源于大致分成两大类：一类要以 生物质燃料資源（草炭或泥炭土等）为关键原料混配而成；另一类要以经发醇、沤肥、碳化等解决的废料生物质燃料資源（秸杆、菌糠、谷壳等）为关键原料或加上原料混配而成。这两大类育苗基质均具备色泽松散透亮、无结团等优势，较为适合机械设备栽种工作。其不利条件是吸咐工作能力相对性较差，不可以非常好地蓄剩水、肥、热等，特别是在以秸杆等废料資源生产加工的育苗基质，经常因为蓄存能力较差而造成床土温度受棚外环境危害大，温度起伏力度高过培养土。