水稻基质育苗栽种后选用基质填土，经常因为基质密度偏轻而出現遮盖土被幼苗顶起的状况，产生块状或零星机盖。基质的关键成份是草炭或秸杆等废料資源沤肥解决物质等，并未产生相近土壤层的土壤胶体，吸咐工作能力较弱。加上基质色泽松散透亮，进到自然通风炼苗环节后，床土缺水迅速，幼苗总会出現少水病症。 基质育苗的病虫害预防 水稻育苗基质生产加工加工过程中一般开展高溫杀菌，既可消灭引起出苗病虫害产生的土传病原菌，也使基质中的草种缺失魅力，具备缓解病虫害和草害产生的功效。可作水稻基质育苗時间偏早时，经常因为大棚温度变波幅很大而扩大青青枯病的产生概率，从而减少幼苗素养。

育苗基质的适用性无土基质的优点之一是可以创造植物根系生长所需要的 环境条件，即 的水气比例。气生根、肉质根需要很好的通气性，同时需要保持根系周围的湿度达80%以上，甚至100%的水气。粗壮根系要求湿度达80%以上，通气较好。 纤细根系如杜鹃花根系要求根系环境湿度达80%以上，甚至100%，同时要求通气良好。当有些基质的某些性状有碍作物栽培时，如果采取经济有效的措施能够消除或者改良该性状，则这些基质也是适用的。例如，新鲜甘蔗渣的C/N比很高，育苗基质在种植作物过程中会发生微生物对氮的强烈固定而妨碍作物的生长。 在空气湿度大的地区，一些透气性良好的基质如松针、锯末非常合适，而育苗基质在大气干燥的北方地区，这种基质的透气性过大，根系容易风干。北方水质碱性，要求基质具有一定的氢离子浓度调节能力，选用泥炭混合基质的效果就比较好。